Tragikus hirtelenséggel elhunyt az Altavista atyja, a web egyik úttörője
Flaherty a később a Compaq által felvásárolt Digital Equipment Corporationek (DEC) dolgozott (a Compaqot azóta elnyelte a HP), mikor az az ötlet jutott eszébe, hogy az interneten található weboldalakat indexelni kellene, azaz jegyzékbe venni, és tartalmukat kereshetővé tenni. Két másik mérnökkel 1995-ben fejlesztették ki az Altavistát kiszolgáló technológiát.
A web ekkor még gyerekcipőben járt, hiszen alig 4 éve indult világhódító útjára, miután Tim Berners-Lee, a svájci CERN egyik kutatója kifejlesztette azt, a tudósok közötti információcsere megkönnyítésére. Az Altavista 1995 decemberében vált nyilvánosan elérhető, pár hét múlva pedig már napi többmillió keresést futtatott, rátapintva a web egyik nagy problémájára, a megfelelő információ megtalálásának nehézségére. Egy év alatt a felhasználók havi száma többmilliót tett már ki. Az Altavista korai változata megtekinthető az Internet Archívumban.
A rendkívül sikeresen induló Altavistát 1999-ben, profiltisztításként leválasztotta magáról a DEC, és önálló vállalattá faragta. Flaherty ekkor a műszaki stratégiáért felelős igazgatóként működött a cégnél, mígnem 2000-ben megvált gyermekétől, és tanácsadóként folytatta karrierjét. Halálakor a kommunikációs szoftvereket fejlesztő TalkPlus alelnökeként tevékenykedett.